Il Museo si trova all’ultimo piano del Dipartimento di Scienze Biologiche, Geologiche ed Ambientali, (nei piani sottostanti c’è il Museo di Zoologia), in via Selmi 3 a Bologna.
Il Museo risale al 1908, anno in cui venne istituita all'Università di Bologna la cattedra di Antropologia, e il primo nucleo della raccolta venne collocato in due stanze di Palazzo Poggi. Nel 1991 il Museo venne riallestito e nel 1993 venne trasferito nell'attuale sede.
Il materiale, che documenta la storia e l'evoluzione dell'uomo, è diviso in tre settori. Il primo è quello di Paleoantropologia e Preistoria, dove si trovano calchi di scheletri e crani insieme a ricostruzioni degli ambienti preistorici per una migliore comprensione. C'è, inoltre, una raccolta di ossa appartenenti al Neolitico fino all'epoca romana e un'esposizione multimediale sul lungo cammino dell'uomo, che aiuta a comprendere meglio la Paleoantropologia. La seconda sezione è quella di Strumenti e Metodi Antropometrici, ed espone il materiale e gli attrezzi usati dall'antropometria, tra cui anche quelli inerenti l'antropologia criminale del Lombroso. Si trovano oggetti per misurare la vista, lo scheletro, e scale cromatiche per studiare i diversi colori degli occhi, dei capelli e dell'incarnato. L'ultimo è il settore Uomo e Ambiente, nel quale una serie di vedute panoramiche racconta il rapporto uomo-ambiente in varie condizioni geografiche e culturali. Si trovano qui riunite, inoltre, diverse collezioni di calchi novecenteschi di visi e busti, realizzati per studiare la Biologia delle razze. Da segnalare la ricostruzione di uno spazio urbano, oltre a quelli naturali, e una Yurta, ovvero una capanna dei popoli delle steppe asiatiche acquistata dall'Accademia delle Scienze di Almaty, nel Kazakistan.
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