Il Museo si trova in alcune stanze della Specola, una settecentesca torre di Palazzo Poggi, in via Zamboni 33, dalla quale venivano effettuate osservazioni astronomiche tra il XVIII e il XIX secolo.
La raccolta del Museo è composta principalmente dagli strumenti utilizzati dall'Osservatorio Marsiliano, che vennero trasferiti nella Specola a inizio Settecento. In quel periodo confluirono in quel luogo anche altre collezioni, come quella di armi, manufatti e oggetti curiosi del Cospi. Nel 1979 cominciarono i lavori di restauro degli strumenti astronomici. Il Museo è composto da diversi ambienti: la Sala Meridiana, Sala Horn d’Arturo, la Sala dei globi e quella della Torretta. La collezione esposta offre un panorama sulla storia dell'osservazione astronomica, attraverso il progresso degli strumenti dal primo Settecento all'Ottocento.
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